Внимание поклонников Райо привлекли два неординарных события: во-первых, заключение договора о сотрудничестве с мадридском Атлетико, а во-вторых повышение команды в классе и переходе на национальный уровень
Финал чемпионата состоялся 27 февраля 1949 года. Официальный тренер Райо Луис Перес Лопес вместе с руководством команды и “теневым” тренером Томасом Родригесом Рубио думал выставить на финал тот же самый состав, который обыграл Куатро Каминос, единственная позиция которая вызывала сомнения была позиция центрального нападающего: он сомневался снова ли выпустить Аррегуи или поставить Санчеса (Чули).
На собрании руководства клуба 13 ноября 1947 года было приняло решение со смены названия с Agrupación Deportiva El Rayo (Спортивное Объединение Райо) на Agrupación Deportiva Rayo Vallecano Rayo (Спортивное Объединение Райо Вальекано), так же руководство клуба решило обратиться к мэрии Вальекаса с просьбой разместить на эмблеме клуба официальный герб Вальекаса. Последнюю просьба мэрия без каких-либо проблем удовлетворила.
Единственное, что спасло Райо от участия в переходных играх было то, что команда Фуйма снялась с чемпионата вскоре после начала второго круга. Если бы этого не случилось Райо скорее всего не избежал бы понижения в классе.
В первых шести турах команде удалось добыть только одну победу, три матча сыграть в ничью, в двух матчах Райо потерпел поражения. Очутившись после старта в середине таблицы, команда очнулась и начала демонстрировать такую игру, что её казалось было невозможно обыграть.
Определенный проблеск наступил в конце сезона, когда команда выдала отрезок из четырех побед подряд и ей удалось опередить в таблицу две команды и подняться из зоны прямого вылета в зону переходных матчей за право сохранить место в региональной Примере. Но все равно Райо очнулся слишком поздно. По итогам чемпионата команда заняла седьмое место, набрав 13 очков, и в переходных матчах за право сохранения места в дивизионе должна была сыграть с Плюс Ультрой. В этом матче Райо был явно не на высоте и, проиграв 2:3, вылетел в региональную Сегунду.
Президент клуба Мигель Родригес Алсола был отстранён от должности и в течение пяти лет ему было запрещено занимать управляющие должности “за то, что его действия не основывались на принципе честности, которым должны следовать президенты, в полной мере отвечающие за все, что происходит в обществах, которыми они управляют”.
Для того, чтобы выйти в стадию, где разыгрывался выход в национальную Терсеру команде не хватило одного очка. Журнал Гол, подводя итого сезона, отметил что Райо провел хороший сезон и назвал команду “Великолепным третьим”.
Победа 20 апреля обеспечила Райо чемпионство за один тур до конца чемпионата. Спустя неделю, 27 апреля 1941 Райо на своем поле со счетом 5:2 обыграл Оэсте, таким образом Райо закрепил статус самый сильной команды региональной Сегунды, намного опередив конкурентов и набрав 16 очков из 20 возможных. Сьюдад Реаль, занявший второе место, уступил на финише вальеканцам пять очков.
